明清时期

1403年至1404年(明永乐元年至二年) 明廷派“行人”(官职，司传旨、册封等事)邢枢赴黑龙江下游特林地方招抚吉烈迷诸部，1404年返回。各部首领相率入京贡献礼物，接受朝廷封赏，钦命于特林置“奴尔干卫”。

中华民国

自1929年中东路事件后，前苏联（今俄罗斯）对该岛实行军事管控，强行驱走岛上原有居民，并控制黑龙江与乌苏里江通航水域，在银龙岛、北代岛及东正教堂处建有5个边防哨所。沿中国侧岛边设有铁丝网约40公里，抚远水道上、下口处俄方都有炮艇驻守。

中华人民共和国

2005年6月16日，中俄两国组成的联合测图小组，在黑瞎子岛地区进行为期一个月的野外联合测图作业。 根据中俄联合测图工作组达成的协议，中方负责抚远水道以南地区，俄方负责黑瞎子岛和黑龙江江岸以北地区，各自负责任务完成后，双方互相到对方的区域复检。